Die Eltern und Erzieher*innen des Vereins für Waldorfeckernförde e.V. tragen gemeinsam die Verantwortung für den Waldorfkindergarten Eckernförde. Der Kindergarten wird in Selbstverwaltung geführt, wobei der Vorstand für die wirtschaftliche Leitung zuständig ist und eine*n Geschäftsführer*in benennt. Wichtige Entscheidungsgremien sind der Vorstand, die Geschäftskonferenz, der Beirat und die Mitgliederversammlung. Alle Beteiligten engagieren sich aktiv in verschiedenen Bereichen, wie bei Festen oder in der Arbeit in den Häusern und Gärten. Die jeweiligen Positionen werden jährlich zu Beginn des Kindergartenjahres benannt und den Eltern und Mitarbeiter*innen zur Verfügung gestellt.